يتولى مساعد الأمين العام للشؤون الفنية الأكاديمية المهام التالية:
- اقتراح السياسات العامة للمديريات التالية:
مديرية مؤسسات التعليم العالي.
مديرية البعثات.
مديرية الاعتراف ومعادلة الشهادات.
مكاتب المستشارين الثقافيين.
- إعداد الخطط الخاصة ببرامج ومشاريع المديريات التي ترتبط به.
- الإشراف على تقييم هذه الخطط والبرامج وتغييرها ومتابعتها.
- المشاركة في تطوير العمل وتنمية طرق الأداء وأساليبه الفنية والإجرائية.